Grapevine Genetic and Genomic Group (*English*)

De Mendoza CONICET

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(Grapevine Genetic and Genomic Group / Genética y Genómica de Vid (*Español*) /)
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Nuestro grupo de investigación está interesado en conocer los mecanismos genéticos y moleculares de la vid, responsables de la regulación de diferentes caracteres relacionados con la calidad de las uvas y el vino. En particular nuestra actividad se centra en el estudio del control genético de los perfiles de antocianos en la piel de las uvas, el análisis genético y molecular de la familia génica estilbeno sintasa (STS) que regula la producción de resveratrol y el estudio de genes que intervienen en determinación del tamaño y la forma de la baya.
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Our group is interested in understanding the genetic and molecular mechanisms of the grapevine, responsible for the regulation of different traits related to the grape and wine quality. In particular our work focuses on: i) studying the genetic control of the anthocyanins profiles in grape skin; ii) the molecular and genetic analysis of stilbene synthase gene family (STS) that regulates the production of resveratrol; and iii) the study of genes involved in determining the size and shape of the berry.
Nuestra aproximación se basa en caracterizar y explotar la variación genética natural que existe en la vid para estos caracteres utilizando herramientas genéticas y genómicas. Para ello, colaboramos también con otros grupos en la caracterización y análisis genético de distintos materiales de vid  (variedades, accesiones silvestres, clones, variantes somáticas y poblaciones de mapeo). Además, participamos en el desarrollo y aplicación de nuevas herramientas de análisis genómico como marcadores moleculares de tipo SNP y micro-satélites, así como microarrays de vid para el análisis de expresión génica global (transcriptómica).
Nuestra aproximación se basa en caracterizar y explotar la variación genética natural que existe en la vid para estos caracteres utilizando herramientas genéticas y genómicas. Para ello, colaboramos también con otros grupos en la caracterización y análisis genético de distintos materiales de vid  (variedades, accesiones silvestres, clones, variantes somáticas y poblaciones de mapeo). Además, participamos en el desarrollo y aplicación de nuevas herramientas de análisis genómico como marcadores moleculares de tipo SNP y micro-satélites, así como microarrays de vid para el análisis de expresión génica global (transcriptómica).

Revisión de 20:15 17 jun 2011

Contenido

Grapevine Genetic and Genomic Group / Genética y Genómica de Vid (*Español*)

Research lines

Our group is interested in understanding the genetic and molecular mechanisms of the grapevine, responsible for the regulation of different traits related to the grape and wine quality. In particular our work focuses on: i) studying the genetic control of the anthocyanins profiles in grape skin; ii) the molecular and genetic analysis of stilbene synthase gene family (STS) that regulates the production of resveratrol; and iii) the study of genes involved in determining the size and shape of the berry.

Nuestra aproximación se basa en caracterizar y explotar la variación genética natural que existe en la vid para estos caracteres utilizando herramientas genéticas y genómicas. Para ello, colaboramos también con otros grupos en la caracterización y análisis genético de distintos materiales de vid (variedades, accesiones silvestres, clones, variantes somáticas y poblaciones de mapeo). Además, participamos en el desarrollo y aplicación de nuevas herramientas de análisis genómico como marcadores moleculares de tipo SNP y micro-satélites, así como microarrays de vid para el análisis de expresión génica global (transcriptómica).

El conocimiento generado tiene aplicación directa en la selección de clones y variedades con nuevas características productivas. Por otra parte, las herramientas obtenidas tienen una amplia aplicación en la identificación varietal o en el seguimiento del desarrollo de la vid o de su respuesta a distintas condiciones ambientales o de cultivo.



Integrantes

  • Diego Lijavetzky - Investigador Adjunto (CONICET) (Investigador Principal)
  • Claudio Muñoz - Becario Posgrado Tipo I (CONICET)
  • Constanza Soledad Chialva - Becaria Posgrado Tipo I (CONICET)
  • Cecilia Grissi - tesinista de la Lic. en Biología Molecular (UNSL)

Archivo:Foto Grupo web.png


Publicaciones

  • Martínez-Esteso MJ, Sellés-Marchart S, LIJAVETZKY D, Pedreño MA and Bru-Martínez R: A DIGE-based quantitative proteomic analysis of grape berry flesh development and ripening reveals key events in sugar and organic acid metabolism. Journal of Experimental Botany 2011, 62, 2521-2569
  • Pontin MA, Piccoli PN, Francisco R, Bottini R, Martinez-Zapater JM and LIJAVETZKY D: Transcriptome changes in grapevine (Vitis vinifera L.) cv. Malbec leaves induced by ultraviolet-B radiation. BMC Plant Biology 2010, 10:224.
  • Martinez-Zapater JM, Carmona MJ, Díaz-Riquelme J, Fernández L and LIJAVETZKY D: Grapevine Genetics after the Genome Sequence: Challenges and Limitations. Australian Journal of Grape Wine Research 2010, 16(s1):33-46.
  • MUÑOZ C, Gómez Talquenca S, Oriolani E, Combina M. Genetic characterization of grapevine-infecting Botrytis cinerea isolates from Argentina. Revista Iberoamericana de Micología 2010, 27:66-70.
  • Gómez Talquenca S, MUÑOZ C, Grau O, Gracia O. First description of Grapevine leafroll-associated virus 5 in Argentina and partial genome sequence. Virus Genes 2009, 38:184-186.
  • Diaz-Riquelme J#, LIJAVETZKY , D#, Martinez-Zapater JM, Carmona MJ: Genome-Wide Analysis of MIKCC-Type MADS-Box Genes in Grapevine. Plant Physiology 2009, 149:354-369. #Equal contributors.
  • MUÑOZ C, Gómez Talquenca S, Volpe ML. Tetra primer ARMS-PCR for identification of SNP in [beta]-tubulin of Botrytis cinerea, responsible of resistance to benzimidazole. Journal of Microbiological Methods 2009, 78:245-246.
  • LIJAVETZKY D#, Almagro L#, Belchi-Navarro S, Martinez-Zapater JM, Bru R, Pedreno MA: Synergistic effect of methyljasmonate and cyclodextrin on stilbene biosynthesis pathway gene expression and resveratrol production in Monastrell grapevine cell cultures. BMC Research Notes 2008, 1:132. #Equal contributors
  • MUÑOZ C, Gomez Talquenca S, Oriolani E, Arias F. Identificación rápida de distintas razas de Botrytis cinerea en cultivos de vid. Enología.(5):24.
  • LIJAVETZKY D, Cabezas JA, Ibanez A, Rodriguez V, Martinez-Zapater JM: High throughput SNP discovery and genotyping in grapevine (Vitis vinifera L.) by combining a re-sequencing approach and SNPlex technology. BMC Genomics 2007, 8:424.
  • Peng FY, Reid KE, Liao N, Schlosser J, LIJAVETZKY D, Holt R, Martinez-Zapater JM, Jones S, Marra M, Bohlmann J, Lund ST: Generation of ESTs in Vitis vinifera wine grape (Cabernet Sauvignon) and table grape (Muscat Hamburg) and discovery of new candidate genes with possible roles in berry development. Gene 2007, 402:40-50.
  • LIJAVETZKY D, Ruiz-Garcia L, Cabezas JA, De Andres MT, Bravo G, Ibanez A, Carreno J, Cabello F, Ibanez J, Martinez-Zapater JM: Molecular genetics of berry colour variation in table grape. Mol Genet Genomics 2006, 276:427-435.
  • LIJAVETZKY D, Carbonero P, Vicente-Carbajosa J: Genome-wide comparative phylogenetic analysis of the rice and Arabidopsis Dof gene families. BMC Evolutionary Biology 2003, 3.
  • Helguera M, Khan IA, Kolmer J, LIJAVETZKY D, Zhong-qi L, Dubcovsky J: PCR assays for the Lr37-Yr17-Sr38 cluster of rust resistance genes and their use to develop isogenic hard red spring wheat lines. Crop Science 2003, 43:1839-1847.
  • Carrari F, Benech-Arnold R, Osuna-Fernandez R, Hopp E, Sanchez R, Iusem N, LIJAVETZKY D: Genetic mapping of the Sorghum bicolor vp1 gene and its relationship with pre-harvest sprouting resistance. Genome 2003, 46:253-258.
  • Carrari F, Perez-Flores L, LIJAVETZKY D, Enciso S, Sanchez R, Benech-Arnold R, Iusem N: Cloning and expression of a sorghum gene with homology to maize vp1. Its potential involvement in pre-harvest sprouting resistance. Plant Molecular Biology 2001, 45:631-640.
  • Carrari F, Frankel N, LIJAVETZKY D, Benech-Arnold R, Sanchez R, Iusem ND: The Tata-less promoter of VP1, a plant gene controlling seed germination. DNA Sequence 2001, 12:107-114.
  • LIJAVETZKY D, Martinez MC, Carrari F, Hopp HE: QTL analysis and mapping of pre-harvest sprouting resistance in sorghum. Euphytica 2000, 112:125-135.
  • Tranquilli G, LIJAVETZKY D, Muzzi G, Dubcovsky J: Genetic and physical characterization of grain texture-related loci in diploid wheat. Molecular and General Genetics 1999, 262:846-850.
  • LIJAVETZKY D, Muzzi G, Wicker T, Keller B, Wing R, Dubcovsky J: Construction and characterization of a bacterial artificial chromosome (BAC) library for the A genome of wheat. Genome 1999, 42:1176-1182.
  • Dubcovsky J, LIJAVETZKY D, Appendino L, Tranquilli G: Comparative RFLP mapping of Triticum monococcum genes controlling vernalization requirement. Theoretical and Applied Genetics 1998, 97:968-975.
  • Rossi M, LIJAVETZKY D, Bernacchi D, Hopp HE, Iusem N: Asr genes belong to a gene family comprising at least three closely linked loci on chromosome 4 in tomato. Molecular & General Genetics 1996, 252:489-492.

Proyectos financiados

  • Caracterización de clones de vid mediante herramientas analíticas y genómicas. Convenio de colaboración científico-tecnológico financiado por la bodega Catena-Zapata (Bodegas Esmeralda S.A.). (IP: Diego Lijavetzky)
  • Caracterización de variedades y clones de vid mediante herramientas genómicas. ES/09/07. Programa de Cooperación Científico-Tecnológica MINCYT (Argentina) y MICINN (España). (IP: Diego Lijavetzky)
  • Utilización y desarrollo de herramientas genómicas y transcriptómicas para la caracterización y el estudio de cultivares y clones de vid (Vitis vinifera). PRH-PICT2008-00270. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. (IP: Diego Lijavetzky)
  • Regulación genética de la acumulación de resveratrol en vid. Variación genética natural y respuesta a diferentes tipos de estrés. PAE-PICT-02360. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. (IP: Diego Lijavetzky)
  • Generación, transferencia y difusión de conocimientos científicos y tecnológicos para fortalecer la innovación, la sustentabilidad y la competitividad de la Vitivinicultura Argentina. PAE2006. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. (IP: Rubén Bottini)
  • GRASP Grape wine: Genomic research-assisted breeding for sustainable production of quality grapes and wine. ERA-NET Plant Genomics (Sixth Framework Programme) (IP: José Miguel Martinez-Zapater)
  • Genómica funcional del mecanismo de elicitación de cultivos celulares vegetales para la producción de compuestos con actividad anti-tumoral. FUNDACION SENECA. Murcia. (IP: María Angeles Pedreño García)


Contacto

Instituto de Biología Agrícola de Mendoza (IBAM)

Facultad de Ciencias Agrarias-UNCuyo

Almirante Brown 500 - (5505)

Chacras de Coria, Mendoza, Argentina

Tel: +54 261 4135010 Ext. 1307

FAX: +54 261 4960469

E-mail1: dlijavetzky@conicet.gov.ar

E-mail2: diegolija@hotmail.com

Web: http://bit.ly/IBAM-Genetica_y_Genomica_de_Vid


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