Grupo de Evolución Molecular de Plantas

De Mendoza CONICET

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(Recursos Humanos)
 
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=Laboratorio de Evolución Molecular de Plantas=  
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===Investigador Responsable===
===Investigador Responsable===
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Dra. María Virginia Sánchez Puerta. [[Media:MVSanchezPuertaCV2013.pdf]]
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[https://sites.google.com/site/sanchezpuerta/Home Dra. María Virginia Sánchez Puerta]
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===Integrantes===
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===Recursos Humanos===
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* Lic. Cinthia Abbona, tesista doctoral, beca CONICET, 2010-presente. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
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* Lic. Laura E. García, tesista doctoral, beca CONICET, 2010-presente. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
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* Lic. Diana Segura, tesista doctoral, 2009-presente. Director: Dra. Masuelli, co-directora: Dra. Sanchez Puerta.
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* Josefina Wohlfeiler, estudiante de Biología FCEN-UNCuyo, beca Sectyp-UNCuyo de investigación, 2013-2015.
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* Federico  Ceriotti, estudiante de Biología FCEN-UNCuyo, beca CIN de investigación. 2014-2015.
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* Melisa Kozaczek, tesina de grado de la Lic. Genética, U.N. Misiones. Directora: Dra. Paz, o-directora: Dra. Sanchez Puerta. 2013-2014.
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* Martín Lopez Appiolaza, técnico profesional de CONICET. 2013-presente.
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QUERES SUMARTE AL GRUPO DE INVESTIGACION?
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Oportunidad para solicitar beca doctoral o postdoctoral del CONICET bajo la dirección de la Dra. Sanchez Puerta
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  Tema: Evolución y biología molecular de plantas parásitas.''''''
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* Lic. Cinthia Abbona, tesista doctoral (beca doctoral tipo I del CONICET), 2010-2013. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
 
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* Lic. Laura E. García, tesista doctoral (beca doctoral tipo I del CONICET), 2010-2013. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
 
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* Lic. Diana Segura, tesista doctoral (beca doctoral tipo II del CONICET), 2011-2013. Director: Dra. Masuelli, co-directora: Dra. Sanchez Puerta.
 
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* Tamara Valdovinos, tesinista de la Lic. en Genética (Universidad de Misiones), 2010-2011. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
 
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  Oportunidad para solicitar beca doctoral o postdoctoral del CONICET bajo la dirección de la Dra. Sanchez Puerta
 
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  Tema: Transferencia Horizontal de Genes entre Plantas. [[Media:ProjectSummary.pdf]]
 
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===Proyectos de Investigación===
===Proyectos de Investigación===
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El objetivo general es comprender la evolución de las angiospermas a nivel molecular.  Las principales líneas de interés incluyen la evolución de genes localizados en los tres compartimientos celulares (en particular en el núcleo y mitocondria), la incidencia y los mecanismos de la transferencia horizontal de genes entre plantas, la evolución de familias de genes, la interacción molecular entre el núcleo y la mitocondria, las relaciones evolutivas de las angiospermas y las bases genéticas de la resistencia o tolerancia a patógenos.  
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El objetivo general es comprender la evolución de los genes y genomas.  Las principales líneas de interés incluyen la evolución de genes localizados en los tres compartimientos celulares (núcleo, mitocondria y cloroplastos), la incidencia y los mecanismos de la transferencia horizontal de genes, la evolución de familias de genes, la interacción molecular entre el núcleo y la mitocondria, las relaciones evolutivas de los eucariotas y la sistemática molecular.  
Las líneas de investigación incluyen:  
Las líneas de investigación incluyen:  
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====[[Transferencia horizontal de genes entre plantas]]====
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====[[Evolución genómica en plantas]]====
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* Transferencia horizontal de genes mitocondriales entre angiospermas, incluyendo plantas parásitas.
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* Transferencia horizontal de genes entre angiospermas, incluyendo plantas parásitas.
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* Estudios sobre la recombinacion de genomas mitocondriales en cíbridos (híbridos citoplasmáticos) de Solanaceas.
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* Estudios sobre la dinámica y recombinacion de genomas mitocondriales en cíbridos (híbridos citoplasmáticos).
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* Análisis bioinformático de secuencias de genomas mitocondriales y cloroplásticos (next-generation sequencing).
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* Análisis bioinformático de secuencias de genomas mitocondriales y cloroplásticos (next-generation sequencing) de angiospermas.
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* Evolución y sistemática de plantas parásitas.
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====[[Resistencia al ataque de nematodos del nudo en papas silvestres]]====
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====[[Taxonomía y evolución molecular de nematodos del nudo]]====
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* Evolución de genes de resistencia en especies de papas silvestres (Solanum spp.).
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* Estudios de sistemática molecular en nematodos fitoparásitos.
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* Evaluación de la resistencia al ataque de nemátodos del nudo (Meloidogyne spp.) en papas silvestres.
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* Caracterización y análisis bioinformático de genomas mitocondriales de especies del género Meloidogyne.
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* Evaluación de la resistencia al ataque de nemátodos del nudo en papas silvestres.
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===Publicaciones===
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===Publicaciones más relevantes===
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*Sánchez Puerta, M. V., M.K. Zubko & J.D. Palmer. 2014. Homologous recombination and retention of a single form of most genes shape the highly chimeric mitochondrial genome of a cybrid plant. New Phytol. (in press).
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*García, L.E. & M.V. Sánchez Puerta. 2012. Characterization of a root-knot nematode population of Meloidogyne arenaria from Tupungato (Mendoza, Argentina). J. Nematol. 44: 291-301.  
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*Sánchez Puerta, M. V. & C.C. Abbona. 2014. The chloroplast genome of ''Hyoscyamus niger'' and a phylogenetic study of the tribe Hyoscyameae (Solanaceae). PloS ONE 9:e98353.
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*Lapadula, W., M.V. Sánchez Puerta & M Juri Ayub. 2012. Convergent evolution led ribosome inactivating proteins to interact with ribosomal stalk. Toxicon 59: 427-432. [[Media:Lapadula2012.pdf]]
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*Rice D.W., A.J. Alverson, A.O. Richardson, G.J. Young, M. V. Sanchez-Puerta, J. Munzinger, K. Barry, J.L. Boore, Y.Zhang, C.W. dePamphilis, E.B.Knox & J.D. Palmer. 2013. Horizontal Transfer of Entire Genomes via Mitochondrial Fusion in the Angiosperm ''Amborella''. Science 342:1468-1473.
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*García, L.E, D.M.Segura, R.W.Masuelli & M.V. Sánchez Puerta. 2013, Evaluating root-knot nematode infection in wild potatoes. Nematropica 143 (in press).
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*García, L.E. & M.V. Sánchez Puerta. 2012. Characterization of a root-knot nematode population of ''Meloidogyne arenaria'' from Tupungato (Mendoza, Argentina). J. Nematol. 44: 291-301.  
*Sánchez Puerta, M. V. , C.C. Abbona, S. Zhuo, E. Tepe, L. Bohs, R.G. Olmstead & J.D. Palmer. 2011. Multiple recent horizontal transfers of the cox1 intron in Solanaceae and extended coconversion of flanking exons. BMC Evol. Biol. 11: 277. [http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/277 pdf]
*Sánchez Puerta, M. V. , C.C. Abbona, S. Zhuo, E. Tepe, L. Bohs, R.G. Olmstead & J.D. Palmer. 2011. Multiple recent horizontal transfers of the cox1 intron in Solanaceae and extended coconversion of flanking exons. BMC Evol. Biol. 11: 277. [http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/277 pdf]
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* Hoffman, G.E., M.V. Sánchez Puerta & C.F. Delwiche. 2011. Evolution of light-harvesting complex proteins from Chl c containing algae. BMC Evol. Biol. 11:101. [http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/101  pdf]
 
* Sánchez Puerta, M. V. & R. W. Masuelli. 2011. Evolution of nematode-resistant Mi -1 gene homologs in three species of ''Solanum''. Mol. Genet. Genomics 285: 207-218.[[Media:SanchezPuerta2011.pdf]]
* Sánchez Puerta, M. V. & R. W. Masuelli. 2011. Evolution of nematode-resistant Mi -1 gene homologs in three species of ''Solanum''. Mol. Genet. Genomics 285: 207-218.[[Media:SanchezPuerta2011.pdf]]
* Sánchez Puerta, M. V. , Y. Cho, J. Mower, A.J. Alverson & J.D. Palmer. 2008. Frequent, phylogenetically local horizontal transfer of the ''cox1'' group I intron in flowering plant mitochondria. Mol. Biol. Evol. 25(8):1762-1777. [[Media:SanchezPuerta2008.pdf]]
* Sánchez Puerta, M. V. , Y. Cho, J. Mower, A.J. Alverson & J.D. Palmer. 2008. Frequent, phylogenetically local horizontal transfer of the ''cox1'' group I intron in flowering plant mitochondria. Mol. Biol. Evol. 25(8):1762-1777. [[Media:SanchezPuerta2008.pdf]]
* Sánchez Puerta, M. V. & C.F. Delwiche. 2008. A hypothesis for plastid evolution in chromalveolates (mini-review). J. Phycol. 44: 1097-1107.  
* Sánchez Puerta, M. V. & C.F. Delwiche. 2008. A hypothesis for plastid evolution in chromalveolates (mini-review). J. Phycol. 44: 1097-1107.  
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* Sánchez Puerta, M. V., T.R. Bachvaroff & C.F. Delwiche. 2007. Sorting wheat from chaff in multi-gene analyses of chlorophyll c-containing plastids. Mol. Phylogenet. Evol. 44: 885-897.
 
* Sánchez Puerta, M. V., J.C. Lippmeier, K. Apt & C.F. Delwiche. 2007. Plastid genes in a non-photosynthetic dinoflagellate. Protist 158 (1): 105-117.
* Sánchez Puerta, M. V., J.C. Lippmeier, K. Apt & C.F. Delwiche. 2007. Plastid genes in a non-photosynthetic dinoflagellate. Protist 158 (1): 105-117.
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* Sánchez Puerta, M. V.,  P.I. Leonardi, C.J O’Kelly & E.J. Cáceres. 2006.  ''Pseudulvella americana'' belongs to the order Chaetopeltidales (Class Chlorophyceae), evidence from ultrastructure and SSU rDNA sequence data . J. Phycol  42:943-950.
 
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* Bachvaroff, T.R., M.V. Sánchez Puerta & C.F. Delwiche. 2006. Rate variation as a function of gene origin in plastid-derived genes of peridinin-containing dinoflagellates. J. Mol. Evol. 62:42-52.
 
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* Sánchez Puerta, M. V., T.R. Bachvaroff & C.F. Delwiche. 2005. The complete plastid genome sequence of the haptophyte ''Emiliania huxleyi'': a comparison to other plastid genomes. DNA Research 12:151-156.
 
* Bachvaroff, T.R., M.V. Sánchez Puerta & C.F. Delwiche. 2005. Chlorophyll c containing plastid relationships based on analyses of amulti-gene dataset with all four chromalveolates lineages. Mol. Biol. Evol. 22:1-11
* Bachvaroff, T.R., M.V. Sánchez Puerta & C.F. Delwiche. 2005. Chlorophyll c containing plastid relationships based on analyses of amulti-gene dataset with all four chromalveolates lineages. Mol. Biol. Evol. 22:1-11
* Sánchez Puerta, M. V., T.R. Bachvaroff & C.F. Delwiche. 2004. The complete mitochondrial genome sequence of the haptophyte ''Emiliania huxleyi'' and its relation to heterokonts. DNA Research 11 (1):1-10.
* Sánchez Puerta, M. V., T.R. Bachvaroff & C.F. Delwiche. 2004. The complete mitochondrial genome sequence of the haptophyte ''Emiliania huxleyi'' and its relation to heterokonts. DNA Research 11 (1):1-10.
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* Sánchez Puerta, M. V., P.I. Leonardi & E.J. Cáceres.  2003. Zoospore adhesion and germination upon non-toxic substances in ''Pseudulvella'' sp (Chlorophyta).  Hydrobiologia 513:255-258.
 
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* Sánchez Puerta, M. V. & P.I. Leonardi. 2001.  Ciclo de vida, desarrollo y cariología de ''Klebsormidium nitens'' (Klebsormidiales, Charophyta). Darwiniana 39 (3-4): 223-230.
 
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===Subsidios obtenidos===
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===Subsidios de investigación===
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* 06/M053. “Estudio sobre la resistencia al nemátodo del nudo en papas silvestres”. Secretaría de Ciencia y Técnica de la U.N. Cuyo. Resolución No. 2737/2011-R. 2011-2013. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Co-director: Dr. R.W. Masuelli. Monto total $10.000. [[Media:ResumenM053.pdf]]
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* PICT-2008-277 “Resistance genes to root-knot nematodes in tuber-bearing Solanum species”. Directora: Sánchez Puerta, M. V. 2010-2013. Monto total de $250,000. [[Media:ResumenNematodos.pdf]]
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* R03 TW008353-01 “Genomic studies of chimeric mitochondria in cybrids from Solanaceae”. Subsidio FIRCA-BB (Fogarty International Research Collaboration – Basic Biomedical) del NIH en beneficio de Dra. Sánchez Puerta, en colaboración con Dr. Jeffrey Palmer (Indiana University). 2009-2012. Monto total U$S 150.000. [[Media:ProjectSummary.pdf]]
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* PICT-2008-193. Analysis of horizontal gene transfer in recombinant mitochondria of somatic hybrids from Solanaceae. Directora: Sánchez Puerta, M. V. 2010-2012. Monto total $80,000.
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* FW/09/07. Proyecto bilateral en el marco del Programa de Cooperación Científico-Tecnológica entre MINCyT (Argentina)-FWO (Bélgica). “Estudio sobre mitocondrias recombinantes en híbridos somáticos de Solanaceas”. 2010-2011. Directora: Sánchez Puerta, M. V
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* 06/M022. “Análisis de genes de resistencia al nemátodo del nudo en especies de papa silvestre”. Secretaría de Ciencia y Técnica de la U.N. Cuyo. Resolución No. 1094. 2009-2011. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Monto total $10.000.
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===Docencia===
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* PICT-2008-277 “Resistance genes to root-knot nematodes in tuber-bearing Solanum species”. Directora: Sánchez Puerta, M. V. 2010-2014. Monto total de $250,000. [[Media:ResumenNematodos.pdf]]
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* Profesora Adjunta a cargo de la Asignatura  Microbiología en el [http://www.icb.uncu.edu.ar/ ICB] (Instituto de Ciencias Básicas, U.N. de Cuyo).
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* R03 TW008353-01 “Genomic studies of chimeric mitochondria in cybrids from Solanaceae”. Subsidio FIRCA-BB (Fogarty International Research Collaboration – Basic Biomedical) del NIH en beneficio de Dra. Sánchez Puerta, en colaboración con Dr. Jeffrey Palmer (Indiana University). 2009-2015. Monto total U$S 150.000. [[Media:ProjectSummary.pdf]]
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* Profesora Adjunta en el Dpto de Biología, Facultad de Ciencias Agrarias (U.N. Cuyo)
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* Profesora responsable del curso de Posgrado del [http://www.probiol.uncu.edu.ar/ PROBIOL] (U.N. Cuyo): "Sistemática Molecular de Plantas". Se dicta cada 2 años (2009, 2011, prox. junio 2013).
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* Proyecto Cooperación Internacional CONICET-NSF. 2013-2014. “Analisis genómicos de mitocondrias en cíbridos/ Genomic analyses of cybrid mitochondria”. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Investigador NSF: J.D.Palmer (Indiana University). Monto total $70,000.
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* 06/M075. “Estudio taxonómico, evolutivo y genómico de plantas parásitas y hospedadoras”. Secretaría de Ciencia y Técnica de la U.N.Cuyo. Resolución No. 4540/2013. 2013-2015. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Co-director: Dr. D. Lijavetzky Monto total $15.000.
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última version al 14:11 30 oct 2014

Contenido

Laboratorio de Genómica Evolutiva

English version: Evolutionary Genomics Lab

Investigador Responsable

Dra. María Virginia Sánchez Puerta

Recursos Humanos

  • Lic. Cinthia Abbona, tesista doctoral, beca CONICET, 2010-presente. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
  • Lic. Laura E. García, tesista doctoral, beca CONICET, 2010-presente. Directora: Dra. Sanchez Puerta.
  • Lic. Diana Segura, tesista doctoral, 2009-presente. Director: Dra. Masuelli, co-directora: Dra. Sanchez Puerta.
  • Josefina Wohlfeiler, estudiante de Biología FCEN-UNCuyo, beca Sectyp-UNCuyo de investigación, 2013-2015.
  • Federico Ceriotti, estudiante de Biología FCEN-UNCuyo, beca CIN de investigación. 2014-2015.
  • Melisa Kozaczek, tesina de grado de la Lic. Genética, U.N. Misiones. Directora: Dra. Paz, o-directora: Dra. Sanchez Puerta. 2013-2014.
  • Martín Lopez Appiolaza, técnico profesional de CONICET. 2013-presente.
QUERES SUMARTE AL GRUPO DE INVESTIGACION?
Oportunidad para solicitar beca doctoral o postdoctoral del CONICET bajo la dirección de la Dra. Sanchez Puerta
 Tema: Evolución y biología molecular de plantas parásitas.'



Proyectos de Investigación

El objetivo general es comprender la evolución de los genes y genomas. Las principales líneas de interés incluyen la evolución de genes localizados en los tres compartimientos celulares (núcleo, mitocondria y cloroplastos), la incidencia y los mecanismos de la transferencia horizontal de genes, la evolución de familias de genes, la interacción molecular entre el núcleo y la mitocondria, las relaciones evolutivas de los eucariotas y la sistemática molecular.

Las líneas de investigación incluyen:

Evolución genómica en plantas

  • Transferencia horizontal de genes entre angiospermas, incluyendo plantas parásitas.
  • Estudios sobre la dinámica y recombinacion de genomas mitocondriales en cíbridos (híbridos citoplasmáticos).
  • Análisis bioinformático de secuencias de genomas mitocondriales y cloroplásticos (next-generation sequencing) de angiospermas.
  • Evolución y sistemática de plantas parásitas.

Taxonomía y evolución molecular de nematodos del nudo

  • Estudios de sistemática molecular en nematodos fitoparásitos.
  • Caracterización y análisis bioinformático de genomas mitocondriales de especies del género Meloidogyne.
  • Evaluación de la resistencia al ataque de nemátodos del nudo en papas silvestres.

Publicaciones más relevantes

  • Sánchez Puerta, M. V., M.K. Zubko & J.D. Palmer. 2014. Homologous recombination and retention of a single form of most genes shape the highly chimeric mitochondrial genome of a cybrid plant. New Phytol. (in press).
  • Sánchez Puerta, M. V. & C.C. Abbona. 2014. The chloroplast genome of Hyoscyamus niger and a phylogenetic study of the tribe Hyoscyameae (Solanaceae). PloS ONE 9:e98353.
  • Rice D.W., A.J. Alverson, A.O. Richardson, G.J. Young, M. V. Sanchez-Puerta, J. Munzinger, K. Barry, J.L. Boore, Y.Zhang, C.W. dePamphilis, E.B.Knox & J.D. Palmer. 2013. Horizontal Transfer of Entire Genomes via Mitochondrial Fusion in the Angiosperm Amborella. Science 342:1468-1473.
  • García, L.E, D.M.Segura, R.W.Masuelli & M.V. Sánchez Puerta. 2013, Evaluating root-knot nematode infection in wild potatoes. Nematropica 143 (in press).
  • García, L.E. & M.V. Sánchez Puerta. 2012. Characterization of a root-knot nematode population of Meloidogyne arenaria from Tupungato (Mendoza, Argentina). J. Nematol. 44: 291-301.
  • Sánchez Puerta, M. V. , C.C. Abbona, S. Zhuo, E. Tepe, L. Bohs, R.G. Olmstead & J.D. Palmer. 2011. Multiple recent horizontal transfers of the cox1 intron in Solanaceae and extended coconversion of flanking exons. BMC Evol. Biol. 11: 277. pdf
  • Sánchez Puerta, M. V. & R. W. Masuelli. 2011. Evolution of nematode-resistant Mi -1 gene homologs in three species of Solanum. Mol. Genet. Genomics 285: 207-218.Media:SanchezPuerta2011.pdf
  • Sánchez Puerta, M. V. , Y. Cho, J. Mower, A.J. Alverson & J.D. Palmer. 2008. Frequent, phylogenetically local horizontal transfer of the cox1 group I intron in flowering plant mitochondria. Mol. Biol. Evol. 25(8):1762-1777. Media:SanchezPuerta2008.pdf
  • Sánchez Puerta, M. V. & C.F. Delwiche. 2008. A hypothesis for plastid evolution in chromalveolates (mini-review). J. Phycol. 44: 1097-1107.
  • Sánchez Puerta, M. V., J.C. Lippmeier, K. Apt & C.F. Delwiche. 2007. Plastid genes in a non-photosynthetic dinoflagellate. Protist 158 (1): 105-117.
  • Bachvaroff, T.R., M.V. Sánchez Puerta & C.F. Delwiche. 2005. Chlorophyll c containing plastid relationships based on analyses of amulti-gene dataset with all four chromalveolates lineages. Mol. Biol. Evol. 22:1-11
  • Sánchez Puerta, M. V., T.R. Bachvaroff & C.F. Delwiche. 2004. The complete mitochondrial genome sequence of the haptophyte Emiliania huxleyi and its relation to heterokonts. DNA Research 11 (1):1-10.

Subsidios de investigación

  • PICT-2008-277 “Resistance genes to root-knot nematodes in tuber-bearing Solanum species”. Directora: Sánchez Puerta, M. V. 2010-2014. Monto total de $250,000. Media:ResumenNematodos.pdf
  • R03 TW008353-01 “Genomic studies of chimeric mitochondria in cybrids from Solanaceae”. Subsidio FIRCA-BB (Fogarty International Research Collaboration – Basic Biomedical) del NIH en beneficio de Dra. Sánchez Puerta, en colaboración con Dr. Jeffrey Palmer (Indiana University). 2009-2015. Monto total U$S 150.000. Media:ProjectSummary.pdf
  • Proyecto Cooperación Internacional CONICET-NSF. 2013-2014. “Analisis genómicos de mitocondrias en cíbridos/ Genomic analyses of cybrid mitochondria”. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Investigador NSF: J.D.Palmer (Indiana University). Monto total $70,000.
  • 06/M075. “Estudio taxonómico, evolutivo y genómico de plantas parásitas y hospedadoras”. Secretaría de Ciencia y Técnica de la U.N.Cuyo. Resolución No. 4540/2013. 2013-2015. Directora: Sánchez Puerta, M.V. Co-director: Dr. D. Lijavetzky Monto total $15.000.

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   IBAM - CONICET; Facultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional de Cuyo, 
   Alte Brown 500, Chacras de Coria (5505), Mendoza, Argentina
   Tel: (54 261) 4135000 - Interno: 1307
   e-mail: sanchezpuerta@gmail.com
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